Am Start übernahm Noriyuki Haga das Kommando und setzte sich direkt in Führung. Hinter dem Ducati-Pilot verwies Yamaha-Pilot Ben Spies in der ersten Kurve mit einem verwegenen Manöver die Aprilia von Max Biaggi auf Platz 3. Monza-Sieger Michel Fabrizio reihte sich als Vierter ein. Biaggi konnte den Speed der Spitze aber nicht lange mitgehen und wurde auch von Fabrizio überholt. Der Ducati-Pilot machte auch mit Ben Spies kurzen Prozess und schnappte sich noch in der zweiten Runde seinen Teamkollegen Haga. Bis zur elften Runde konnte sich Fabrizio an der Spitze behaupten, bis WM-Leader Haga ein paar Kohlen nachlegte und den 24-Jährigen auf Platz 2 verwies. Während Haga die Führung bis ins Ziel behauptete, rangelten Spies und Fabrizo munter um die Positionen. Am Ende konnte sich jedoch der Italiener durchsetzen und bescherte Ducati damit einen Doppelsieg. Yamaha-Pilot Spies büsste mit Rang 3 weitere neun WM-Zähler auf Haga ein. Das Team-Kate-Team konnte den bereits in Monza erkennbaren Aufwärtstrend in Kyalami fortsetzen. Jonathan Rea hielt rundenlang Max Biaggi mit der schnellen Aprilia in Schach und sah als guter Vierter die Zielflagge. Auch Carlos Checa wusste nach bislang eher mageren Vorstellungen mit Rang 6 zu überzeugen. In Abwesenheit des verletzten Max Neukirchners wurde die beste Suzuki von Yukio Kagayama auf Position 8 ins Ziel gebracht. Für Fonsie Nieto, der von Alstare als Ersatz für den Deutschen verpflichtet wurde, reichte es dagegen nur zum 16. Rang.