Im MotoGP-Qualifying 1 mussten sich in Brünn auch ein paar prominente Werksfahrer redlich bemühen, um einen der zwei besten Plätze zu ergattern und sich auf diese Weise fürs Qualifying 2 zu qualifizieren, in dem dann die besten zwölf Startplätze verteilt werden – ab 14.35 Uhr. Nach zehn Minuten lag CWM-LCR-Pilot Cal Crutchlow (mit 1:56,674 min) vor Danilo Petrucci sowie Aleix und Pol Espargaró an der Spitze. Stefan Bradl hielt sich an ausgezeichneter fünfter Position – mit einer Zeit von 1:57,133 min. Teamkollege Alvaró Bautista hielt sich an neunter Position. Im zweiten Run setzte sich Pol Espargaró auf der Tech3-Yamaha mit einer neuen Bestzeit 1:56,534 min auf den ersten Platz vor Crutchlow. Der Brite lag 0,140 sec zurück. Stefan Bradl reichte die Zeit aus dem ersten Run am Schluss für Platz 6, das bedeutet Startplatz 16 für das Rennen am Sonntag. Scott Redding auf der Factory-Honda schob sich noch an Bradl und Aleix Espargaró vorbei. 9. Bautista mit einer Zeit von 1:57,552 min. Pol Espargaró steigerte sich in der zweiten Runde sogar noch auf 1:56,212 min. Crutchlow büsste also 0,326 sec ein, steigt aber trotzdem ins Q2 auf.