WM-Leader Esteve Rabat schloss das dritte freie Training der Moto2-Klasse mit einer Zeit von 1:52,694 min als Schnellster ab. Doch Rookie Jonas Folger aus dem AGR-Team, der in Mugello erstmals mit WP-Suspension-Elementen unterwegs ist, war ihm dicht auf den Fersen. Er büßte nur 0,238 sec auf den Spanier ein und belegte Rang 2. Auch Kalex-Pilot Sandro Cortese verlor lediglich 0,287 sec und schnappte sich somit einen starken dritten Platz. Hinter dem Deutschen reihte sich Schweizer Tom Lüthi ein. Sein Abstand auf die Bestzeit von Rabat lag mit 0,411 sec ebenfalls noch unter einer halben Sekunde. Obwohl Marcel Schrötter nach seinem heftigen Sturz am ersten Trainingstag eine Hüftprellung sowie eine Prellung der rechten Schulter erlitt und am Samstagmorgen zum Medical Check musste, preschte der Bayer auf der Tech3-Maschine unter die Top-10. Er erreichte Rang 9. Auch Suter-Fahrer Dominique Aegerter konnte sich im Vergleich zum Freitag, Platz 25 in FP1 für den Schweizer, am Samstagmorgen deutlich steigern. Er erreichte den 13. Platz. Seine Landsmänner Randy Krummenacher und Robin Mulhauser lagen auf den Rängen 25 und 31.