Die wechselhaften Wetterbedingungen auf dem Sachsenring machten auch den Moto2-Piloten zu schaffen. Zu Beginn des Trainings regnete es, die Fahrer verweilten zum Großteil in ihren Boxen, später ließ der Niederschlag nach. 20 Minuten vor dem Ende des ersten Trainings begann die Zeitenjagd. Johann Zarco übernahm vor Dominique Aegerter, Alex Márquez, Franco Morbidelli, Marcel Schrötter und Jonas Folger die Spitze. Zwei Minuten vor Schluss hatte Assen-Sieger Takaaki Nakagami die Nase vorne, Alex Rins, Marcel Schrötter und Simone Corsi folgten dahinter. Mit 1:25,377 min lag Nakagami am Ende des Training 0,386 sec vor den Top-3 der Gesamtwertung: Johann Zarco, Alex Rins und Sam Lowes. Zum Vergleich: Die Pole-Zeit 2015 lag bei 1:24,044 sec. Dahinter folgten Lorenzo Baldassarri, Franco Morbidelli, Simone Corsi, Marcel Schrötter als Achter und Jonas Folger auf Platz 9. Cortese, Lüthi und Aegerter belegten die Plätze 12, 15 und 17.