Trotz seiner schmerzhaften Handverletzung (Sturz im dritten Training) stieg Sandro Cortese (D/KTM) im Qualifying auf seine KTM. Nach seinem ersten Run musste er sich jedoch eine schmerzstillende Injektion verpassen lassen. Anschliessend fuhr der Deutsche auf Startplatz 4 nach vorne - und in seinem Windschatten Maverick Vinales in 1.53,085 min eine vorläufige neue Bestzeit. Vinales erwies sich auch in der Schlussphase als der schnellste Mann. Fünf Minuten vor Schluss steigerte sich der Spanier zuerst auf 1.52,600 min, um am Ende mit 1.52,160 min die Pole-Position zu erobern. Den zweiten Startplatz sicherte sich der gut aufgelegte Zulfahmi Khairuddin (MAL/KTM) vor Louis Rossi (F) vom Racing Team Germany, dem der Sieg bei seinem Heimrennen in Le Mans offensichtlich auch noch in Barcelona beflügelt. Die zweite Startreihe: Miquel Oliveira (POR/Suter-Honda), Luis Salom (E/Kalex-KTM), Alex Masbou (F/Honda) und Hector Faubel (E/Kalex-KTM). Shooting-Star Romano Fenati (I/FTR) geht nur von Startplatz 12 in das morgige Rennen. Jonas Folger (D/Ioda) und Marcel Schrötter (D/Mahindra) hatten mit ihren von den schwachen Emir- respektive Oral-Motoren angetriebenen Bikes auch in Barcelona nichts zu lachen und qualifizierten sich nur auf den Positionen 28 bzw. 30. Der Schweizer Giulian Pedone startet als 32.