Im trockenen ersten MotoGP-Training in Sepang am Freitag war Weltmeister Marc Márquez aus dem Repsol-Honda-Team der schnellste Mann auf der Strecke. Er war 0,268 sec schneller als Suzuki-Pilot Maverick Viñales. Im zweiten Training erwarteten die MotoGP-Piloten nach Regenschauern gemischte Bedingungen auf dem neu asphaltierten Sepang International Circuit, die Strecke trocknete nach und nach auf. Marc Márquez, der bereits am Donnerstag berichtet hatte, dass er den Mittwoch im Hotel verbracht hatte, da er sich unwohl fühlte, trat nicht zum zweiten Training an, um sich für den Samstag zu schonen. Als Grund wurde eine Magen-Darm-Verstimmung genannt. Seine Bestzeit im Trockenen am Morgen blieb auch die Tagesbestzeit: 2:01,210 min. Loris Baz setzte sich zu Beginn des zweiten Trainings vor seinem Avintia-Ducati-Teamkollegen Héctor Barberá an die Spitze. Barberá hatte in Japan und Australien den verletzten Andrea Iannone auf der Werks-Ducati ersetzt, war aber punktelos geblieben. Beim Malaysia-GP gibt Iannone sein Comeback, doch bei den schwierigen Bedingungen im FP2 rückte der Italiener nicht aus. 30 Minuten vor dem Ende der Session stand Australien-Sieger Cal Crutchlow aus dem LCR-Honda-Team mit 2:14,712 min vor Yonny Hernandez (Ducati), Danilo Petrucci (Ducati), Alvaró Bautista (Aprilia) und Valentino Rossi (Yamaha) an der Spitze. Andrea Dovizioso verdrängte Crutchlow zehn Minuten später vom ersten Platz mit 2:14,465 min. Dahinter folgten Jorge Lorenzo, Yonny Hernandez, Valentino Rossi und Alvaró Bautista. Aprilia-Pilot Stefan Bradl lag auf dem elften Platz hinter Jack Miller auf der Marc VDS-Honda. Obwohl Pol Espargaró in der letzten Kurve ein Fehler unterlief, setzte er sich vor Dovizioso an die Spitze. Er war 0,027 sec schneller als der Ducati-Pilot. Die Streckenbedingungen verbesserten sich merklich, Yonny Hernandez war mit 2:13,586 min ganze 0,852 sec als Espargaró. Der Großteil der Fahrer kehrte an die Box zurück, Crutchlow ließ Slick-Reifen aufziehen und wartete ab. Neun Minuten vor Schluss rückte Crutchlow als erster Fahrer auf Slicks aus. Baz hatte auf Intermediate-Reifen die neue Bestzeit vorgelegt: 2:12,800 min. Bautista schob sich mit 0,413 sec Rückstand auf Platz 2, er war noch auf Regenreifen unterwegs. Stefan Bradl rückte auf Intermediates aus und lag fünf Minuten vor Schluss auf Platz 8. Mit 2:10,855 min war Baz ganze 1,3 sec schneller als Crutchlow auf Slicks. Dovizioso schob sich am Briten vorbei auf Platz 2. Stefan Bradl katapultierte sich auf Platz 4 - 1,462 sec hinter Baz. Mit 2:08,872 min schoss am Ende Jack Miller aus dem Marc VDS-Team an die Spitze. Er war 0,399 sec schneller als Cal Crutchlow. Dahinter reihten sich Héctor Barberá (Ducati) +0,542 sec, Bradley Smith (Yamaha) +0,568, Loris Baz (Ducati) +0,826, Scott Redding (Ducati) +1,303, Andrea Dovizioso (Ducati) +1,336 und Stefan Bradl (Aprilia) +1,411 ein. Der WM-Zweite Valentino Rossi musste sich mit dem 13. Platz und 4,5 sec Rückstand zufrieden geben. Damit lag er vor seinem Yamaha-Teamkollegen Jorge Lorenzo, der nur Platz 16 vor Maverick Viñales belegte.