Als das zweite Moto3-Training auf dem Red Bull Ring begann, trocknete die Strecke immer weiter auf. Zunächst setzte sich Nakarin Atiratphuvapat an die Spitze, wurde jedoch bald von seinem Honda-Kollegen John McPhee abgelöst: 1:45,772 min. Zum Vergleich: Die Pole-Zeit 2016 lag bei 1:36,228 min. 25 Minuten vor Schluss lag Nicolò Bulega aus dem VR46-Team vor Atiratphuvapat, Canet, McPhee und Rookie Arbolino aus dem Team von Paolo Simoncelli an der Spitze. Philipp Öttl aus dem Team Südmetall Schedl GP Racing reihte sich auf dem elften Platz ein. WM-Leader Joan Mir, er liegt in der Gesamtwertung 42 Zähler vor Romano Fenati, schnappte sich mit 1:43,729 min Platz 1. Dahinter folgte Juanfran Guevara (KTM) mit 0,822 min Rückstand vor Antonelli (KTM), Kornfeil (Peugeot), Bulega (KTM), Di Giannantonio (Honda) und Atiratphuvapat (Honda). Philipp Öttl schoss zehn Minuten vor Schluss auf Platz 3 nach vorne. Canet verdrängte Fenati von Platz 1, doch der Italiener aus dem Team Marinelli Rivacold Snipers schlug mit 1:39,706 min zurück. Maria Herrera aus dem AGR-Team schob sich auf Platz 4. In der Schlussphase setzte sich zunächst Adam Norrodin an die erste Position, doch Aron Canet war bald 0,425 sec schneller. Zu diesem Zeitpunkt setzte wieder Regen ein. Mit 1:39,136 min lag Aron Canet (Honda) aus dem Team Estrella Galicia 0,0 an der Spitze vor Adam Norrodin (Honda) +0,357 sec, Enea Bastianini (Honda) +0,540 sec, Romano Fenati (Honda) +0,570 sec, Gabriel Rodrigo (KTM) +0,811 sec und Philipp Öttl (KTM) +0,871 sec. KTM-Pilotin Maria Herrera glänte mit Platz 7. WM-Leader und Vorjahressieger Joan Mir landete mit 3,9 sec Rückstand auf dem 27. Rang. Er fuhr nur sechs Runden.