Der am 5. April 2005 geborene Fermín Aldeguer begann seine Karriere im Alter von fünf Jahren auf einem Pocketbike. Er durchlief die Nachwuchsklassen der spanischen Rennfahrerschule "Cuna de Campeones", bevor er mit dem Gewinn der PreMoto4 Klasse 2017 seinen Durchbruch schaffte. Im Folgejahr startete der Spanier im European Talent Cup, wo er mit zwei Podestplätzen Gesamtrang 10 einfuhr. Auf einigen Umwegen trat Aldeguer 2020 in der CEV Superstock 600-Meisterschaft an und krönte sich auf Anhieb zum Europameister. Nur ein Jahr später gewann er in beeindruckender Manier auf Boscoscuro die Moto2-Europameisterschaft, indem er sich neun von elf möglichen Rennsiegen schnappte. Sein größter Konkurrent war sein Teamkollege Alonso Lopez, der mit 39 Punkten Rückstand Vizemeister wurde. Gleichzeitig gab Aldeguer sein Moto2-WM-Debüt und feierte mit Platz 12 in Mugello sowie Platz 7 in Aragon einen gelungenen WM-Einstand. Diese Leistungen bescherten dem Spanier für 2022 einen Stammplatz im Speed Up Team, wo er ebenfalls sein Talent unter Beweis stellte. Ein vierter Platz in Australien und Valencia waren dabei seine besten Resultate. 2023 trat Fermin Aldeguer neben Alonso Lopez erneut im Speed Up Team in der Moto2-Weltmeisterschaft an. Mit fünf Siegen erlebte der Spanier eine starke Saison, die er als Gesamtdritter beendete. 2024 gelangen ihm drei Saisonsiege und insgesamt fünf Podestplätze, was in der Endabrechnung Platz 5 bedeutete. 2025 bestritt Aldeguer im Team Gresini Racing seine Rookie-Saison in der MotoGP-WM. Sein Teamkollege dort ist Alex Marquez. Aldeguer kam mit der Ducati GP24 gut zurecht, in Indonesien holte er seinen ersten GP-Sieg in der Königsklasse. Der 20-Jährige beendete seine erste MotoGP-Saison auf Gesamtrang 8. Zudem wurde er überlegen Rookie des Jahres. 2026 geht Fermin Aldeguer erneut für Gresini Racing an den Start.