Bei der Superpole der Supersport-WM handelt es sich um ein traditionelles Qualifying, in dem alle Fahrer 20 Minuten lang Zeit haben, um eine bestmögliche Zeit zu fahren. In der Nacht zu Samstag hatte es über der Rennstrecke in Most wie vorhergesagt geregnet, zu Beginn der Superpole um 10:25 Uhr Ortszeit war die Strecke immer noch feucht. In den ersten Minuten gewöhnten sich die Piloten an die Bedingungen. Ganz andere Probleme hatte dagegen Stefano Manzi, der mit seiner Triumph im Schneckentempo um die Piste schlich. Am Freitag fuhr Dominique Aegerter (Ten Kate Yamaha) in 1:34,952 min die schnellste Zeit, die ersten Runden in der Superpole waren gut drei Sekunden langsamer. Mit beinahe jeder Zieldurchfahrt wurden die Zeiten schneller, noch vor Halbzeit fuhr Lorenzo Baldassarri (Yamaha) in 1:35,741 min die erste Zeit unter 1:36 min. Wenig später egalisierte der Italiener die Aegerter-Zeit vom Freitag auf die Tausendstelsekunde. Aegerter wiederum hatte noch Schwierigkeiten, das erforderliche Vertrauen zu den Bedingungen zu finden: Der Schweizer belegte fünf Minuten vor Ende der Session mit 1,4 sec Rückstand nur Platz 11. Mit einem Sturz zu Beginn der heißen Phase verabschiedete sich MV Agusta-Pilot Niki Tuuli aus der Superpole – der Finne wird als 17. in die beiden Rennen starten. Zur sicheren Bergung der F3 800 wurde die Session vier Minuten vor dem Ende unterbrochen. Bei Restart stürmten alle Piloten auf die Piste, um im Idealfall noch zwei fliegende Runden fahren zu können. Die Baldassarri-Zeit blieb unangetastet, die erste Startreihe komplettieren die Ducati-Piloten Federico Caricasulo und Nicolo Bulega. Mit einer Zeitverbesserung auf seiner letzten Runde gelang Dominique Aegerter noch der Sprung auf Platz 4 – erstmals in diesem Jahr verpasste der WM-Leader die erste Startreihe. Bester Kawasaki-Pilot wurde der Yari Montella auf Platz 7, der zuletzt eine aufstrebende Form zeigte. Die MV Agusta stellte Bahattin Sofuoglu auf die 13. Position. Für Triumph sorgte Hannes Soomer als 16. für das beste Ergebnis. Max Kofler (Ducati) qualifizierte sich auf Platz 22. Für Patrick Hobelsberger (Kallio Yamaha) und Marcel Brenner (VFT Yamaha) war die Superpole ein Desaster: Der Österreicher Deutsche erreichte lediglich Platz 27, der Schweizer nur die 29. Position.